Th1 & Th2免疫应答PCR芯片可用于分析辅助T细胞免疫应答相关的84个基因的表达。获得性免疫涉及到T淋巴细胞和B淋巴细胞的激活，用以开启对抗原的特异性免疫应答。辅助T细胞不能独立降解抗原，而是与B细胞协同作用介导进一步的免疫应激反应。研究最为广泛的辅助T细胞，根据自身所分泌的细胞因子和特定的受体分为Th1和Th2两种亚群，分别具有特定的免疫功能。Th1介导细胞免疫反应，分泌IFNG等细胞因子；Th2则介导体液免疫，分泌IL13和IgE等细胞因子。非必要的Th细胞活性反应会导致哮喘、过敏和其它自身免疫性疾病的发生。对T细胞基因的表达和调控的分析可以确定以上两种亚型对实验模型系统的影响和重要性。该芯片涵盖了Th1和Th2细胞的标志基因，同时也包括了和Th1和Th2功能及免疫应答相关的基因。通过实时定量PCR，研究者可以简单可靠地同时分析Th1和Th2免疫应答重要基因的表达。
Th1 Genes: Th1 Markers: CCR5, CXCR3, IFNG, STAT4, TBX21. Th1 Immune Response: CCR2, CD80, EBI3, IL12B, IL18, IL1RL1 (ST2), IL27, IL27RA, IL4R (CD124), SLC11A1, SOCS5, TLR4, TLR6, TNFSF4, VEGFA. Other Th1-Related Genes: CD28, CD40LG (TNFSF5), CSF2 (GM-CSF), HAVCR2, IL12RB2, IL18R1, IL2, IL2RA, IRF1, SOCS1, STAT1, TNF. Cell-Mediated Immunity: BCL6, CD27 (TNFRSF7), CD28, CD40LG (TNFSF5), IFNG, IL10, IL12B , IL2, IL27RA, IL4, IL7R, LTA (TNFB), PTPRC, SLC11A1, STAT6, TBX21, TLR4, TNF, TNFSF4. Th2 Genes: Th2 Markers: CCR4, GATA3, IL13, IL25 (IL17E), IL2RA (CD25), IL4, IL4R (CD124), IL5, STAT6. Th2 Immune Response: BCL6, CCR2, CD86, IL10, IL18, IL27RA, IL6, SOCS5, TNFSF4. Other Th2-Related Genes: CCL11 (Eotaxin), CCL5 (RANTES), CCL7 (MCP-3), CCR3, CEBPB, GFI1, GPR44, ICOS, IL13RA1, IL1R1, IL9, IRF4, JAK1, MAF, NFATC1, NFATC2, PCGF2 (RNF110). Humoral Immunity: CD28, EBI3, IFNG, IL6, IL7, LTA (TNFB), TNF. CD4+ T Cell Markers: CD27 (TNFRSF7), CD4, CD40LG (TNFSF5), CD80, CD86, CREBBP, CTLA4, FASLG (TNFSF6), IL15, IL6, IL6R, IL7, JAK2, LAG3, LAT, MAPK8 (JNK1), PTPRC, TGFB3, TNFRSF8, TNFRSF9, TNFSF4 (OX40L), TYK2, YY1. Other Genes Involved in Inflammatory Response: JAK2, LTA (TNFB), SPP1 (Osteopontin). Other Genes Involved in Immune Response: IL3, SFTPD.