人类miRNA芯片Human miRNA OneArray ® v5
人类 miRNA 芯片 v5 延续 v4 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v5 版芯片于 2013 年 7月正式上线。
探针信息
人类miRNA芯片v5探针内容 |
学名 |
Homo sapiens |
常用中文名称 |
人类 |
探针代表号 |
hsa |
常用英文名称 |
Human |
miRNA探针数 |
2,003 |
总所对应的成熟miRNA数 |
2,019 |
miRNA探针重复数 |
3 |
控制探针数 |
144 |
总探针数 |
6,153 |
基因探针
人类 miRNA 芯片 v5 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计, 共有 2,003 个序列,可对应到 2,019 个成熟的 miRNA, 在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。
控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含样本RNA完整性、样本RNA放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。
小鼠&大鼠miRNA芯片 Mouse&Rat miRNA OneArray® v4
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 延续 v3 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v3 版芯片于 2012 年 3 月正式上线。
探针信息
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 探针内容 |
学名 |
Mus musculus |
Rattus norvegicus |
常用中文名称 |
小鼠 |
大鼠 |
常用英文名称 |
Mouse |
Rat |
探针代表号 |
mmu |
rno |
miRNA探针数 |
1,129 |
676 |
所对应的成熟miRNA |
1,157 |
680 |
RmiOA v3 miRNA探针总数 |
1,362 |
RmiOA v3 所对应的成熟miRNA总数 |
1,837 |
miRNA探针重复数 |
3 |
控制探针数 |
144 |
总探针数 |
4,230 |
基因探针
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计, 共计 1,362 个序列, 可对应到 1,837 个成熟的 miRNA, 在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。
控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含矩阵校准标记探针、 阳性控制探针及阴性控制探针。
华联生物芯片探针设计主要以Sanger miRBase的资料库为主,依资料库的更新状态,定期提供新版本探针内容的人类、小鼠与大鼠的标准miRNA芯片,详细规格如下表:
miRNA芯片 |
基因探针数 |
对应miRNA数 |
控制探针数 |
探针重复数 |
参考数据库 |
HmiOA v3 Human miRNA OneArray |
1,711 |
1,732 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
RmiOA v3 Mouse & Rat miRNA OneArray |
Mouse 1,080 |
Mouse 1,111 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
Rat 680 |
Rat 672 |
MPmiOA v3 Model Plant miRNA OneArray |
1,022 |
1,817 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |