第三代基因测序技术
产品名称: 第三代基因测序技术
英文名称: Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing
产品编号:
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武汉菲沙基因信息有限公司
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技术优势
超长的测序读长:平均测序读长能达到3000至5000碱基,最长的序列能达到20000碱基
可直接检测碱基修饰
可直接进行RNA测序
最小的GC偏向性:在极端高GC和极端低GC区域,可以轻松测定,从而保证序列的均匀覆盖度
无PCR扩增偏向性:样本不需要进行PCR扩增,避免了覆盖度不均一和PCR artifacts
尤其适合微生物基因组的研究
研究内容
基因组、转录组测序和组装
特定目标区域测定
碱基修饰检测
技术服务项目
技术服务项目
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应用说明 |
全基因组De novo测序
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三代测序以平均15K以上读长,解决了高GC、高重复和海量短序列组装等困扰 |
基因组升级和优化 |
三代测序对已完成基因组进行升级,组装效果获得数十倍的提升,能够大幅提高已有基因组的组装指标 |
全长转录组解决方案
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无需打断、无需组装即可直接读取全长转录组信息,准确辨别二代测序无法识别的同源异构体(isoform)、同源基因、超家族基因或等位基因表达的转录本 |
微生物基因组解决方案
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三代测序解决了二代测序序列偏短以及无法很好拼接GC异常和高重复区域等诸多问题,能够快速、准确地获得细菌、真菌、病毒、线粒体、叶绿体和BAC基因组完成图 |
表观组
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PacBio系列在测序中同时检测各种碱基修饰(如5-mC和N6-mA)和DNA损伤,从而揭示表观遗传对控制生长、代谢、分化和癌变相关基因的调控 |