紧密连接PCR芯片可用于研究84个关键基因的表达。紧密连接基因编码的蛋白使上皮细胞之间形成疏水屏障来调节细胞极性、增殖和分化。紧密连接可以使相邻的上皮细胞密闭，也可以使与膜结合的脂类、蛋白质的顶端表面和基底表面之间紧密连接，以防止大部分可溶性分子通过。紧密连接使上皮细胞与其环境以及哺乳动物有机体的内部及内部隔间之间形成一个屏障。如血 - 脑屏障，血管，肠，肾及皮肤。组织和器官系统的发育，都需要形成正确的紧密连接。正常的生理过程，如免疫细胞外渗/白细胞渗出和小肠吸收，需要正确的组装、拆卸和维护紧密连接。紧密连接的完整性和功能性的失调在疾病的病理生理中起着关键作用，如发炎性肠道疾病和肿瘤转移过程中上皮向间质的转化。紧密连接的核心组件包括claudins，occludin和其它的细胞粘附蛋白。它们的胞外域可以作为同种或异种抗原与其它的细胞表面蛋白相互作用，而它们的胞内结构域则与配体蛋白质如actinins，catenins和其它紧密连接蛋白相互作用。这些配体招募蛋白激酶，通过磷酸化级联反应及G-蛋白在连接处重新构建骨架成分来调节细胞骨架。分析紧密连接成分的表达情况可以更好地了解紧密连接介导的细胞生物学分子机制。通过实时定量PCR的方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测紧密连接相关基因的表达。
Cell Surface Receptors Claudins: CLDN1, CLDN10, CLDN11, CLDN12, CLDN14, CLDN15, CLDN16, CLDN17, CLDN18, CLDN19, CLDN2, CLDN3, CLDN4, CLDN5, CLDN6, CLDN7, CLDN8, CLDN9. Occludin: OCLN. Cell Adhesion Molecules: ESAM, ICAM1, ICAM2, PECAM1. Junctional Adhesion Molecules: F11R, IGSF5, JAM2, JAM3. Others: CD99, CRB1, CRB3. Alpha Actinins & Catenins: ACTN1, ACTN2, ACTN3, ACTN4, CTNNA1, CTNNA2, CTNNA3, CTNNB1. Junction Interacting Proteins: ACTN1, ACTN2, ACTN3, ACTN4, AMOTL1, CGN, CSDA, CTTN, EPB41, HCLS1, INADL, MAGI1, MAGI2, MLLT4, MPDZ, PARD3, SYMPK, TJAP1, TJP1, TJP2, TJP3, VAPA, ZAK. Cytoskeleton Regulators: AMOTL1, ASH1L, CSDA, CTTN, LLGL1, LLGL2, PARD3, PARD6A, PARD6B, SPTA1, SPTAN1, SPTB, SMURF1, TIAM1. G Protein Signaling: ARHGEF2, CDC42, CDK4, GNAI1, RAC1, RHOA, SMURF1, TIAM1. Protein Kinase Signaling: CASK, CSNK2A1, CSNK2A2, CSNK2B, ILK, MAGI1, MAGI2, MARK2, MPP5, MPP6, PRKCI, PRKCZ, PTEN.