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上海吉凯基因医学科技股份有限公司
华联表达谱基因芯片

华联表达谱基因芯片

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产品名称: 华联表达谱基因芯片

英文名称:

产品编号: v6等

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产品产地: 台湾

品牌商标: 华联生物

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华联表达谱基因芯片/服务

 

人类表达谱芯片 
      人类表达谱芯片 v6 延续 "One Gene-One Probe" 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。v6 版芯片于 2012 年 9 月正式上市, 根据 RefSeq 51 及 Ensembl 65 数据库进行探针的更新, 以提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。
 
 

探针信息

探针种类 探针数
基因探针设计数据库:
         - RefSeq release 51
         -Ensembl release 65
31,741
控制探针数 938
总探针数 32,679

 


基因探针
 
       人类表达谱芯片 v6 版本的更新是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的人类表达谱基因探针, 内容以 protein-coding gene 为主,相较于 v5 版本, 除了提高整体的基因覆盖率外,更完整的覆盖与生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站,方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。
 
 

控制探针 
      为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证,设计一系列的质量控制探针, 以监控完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。
 

小鼠表达谱芯片

     小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。 
 

探针信息

探针种类 探针数
基因探针设计数据库:
         - RefSeq release 42
         -Ensembl release 59
26,423
控制探针数 872
总探针数 27,295

 

基因探针 
       小鼠表达谱芯片 v2 版次除了保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针外, 更参考国际公认之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提高整体的基因覆盖率外与提供完整的生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
 
 

控制探针 
      为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、 样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。
 
大鼠表达谱芯片 
     大鼠表达谱芯片为全新开发的表达谱芯片产品,与其它表达谱系列产品一样, 采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理,以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 根据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的设计, 提供高基因覆盖率的表达谱芯片,以自主的高速布放技术进行芯片生产。
 
 

探针信息

探针种类 探针数
基因探针设计数据库:
         - RefSeq release 42
         -Ensembl release 59
24,358
控制探针数 980
总探针数 25,338

 

基因探针 
       大鼠表达谱芯片是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长炼 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容主要以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提供高基因覆盖率并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。


控制探针 
      为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、 样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。
 
 

华联目前已有人类、小鼠、大鼠、酵母菌与水稻等表达谱芯片:

 

表达谱产品 总探针数 基因探针数 控制探针数 酵母菌 参考数据库
HOA v5 Huamn OneArray 30,275 29,187 1,088 60 mer RefSeq release 38
Ensembl release 56
MOA v2 Mouse OneArray 27,294 26,423 872 60 mer RefSeq release 42
Ensembl release 59
ROA v1 Rat OneArray 25,338 24,358 980 60 mer RefSeq release 42
Ensembl release 59
YOA v1 Yeast OneArray 7,642 6,958 684 70 mer AROSa v1.1 YBOXb v1.0
RiOA v1 Rice OneArray 22,063 21,179 884 60 mer RGAPc v6.1 BGId(2008)
 
 
 
 
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