疾病特异性芯片
产品名称： 疾病特异性芯片
英文名称： Disease specific chip
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产品价格： 4000
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| 疾病和通路特异性基因表达PCR芯片 | |
| 提供商： | 上海杏园生物科技有限公司 |
| 服务名称： | 疾病和通路特异性基因表达PCR芯片 |
检测细胞系或者样品的基因突变是癌症研究、毒理学和药物研发的关键内容之一，Real-time PCR是检测DNA突变的灵敏可靠的方法。通过将等位基因特异性扩增和水解探针检测相结合，突变位点特异的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因突变。
拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)是基因组发生重排而导致的，一般指长度1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV包含的信息至少是SNP的三倍，因为CNV内部含有基因，所以它在人类疾病和药物应答中起重要的作用。呈孟德尔遗传的单基因遗传病及一些罕见复杂的疾病都与其相关，基因复制量改变、基因断裂、 融合及位置改变都可能是它的致病机理。基于Real-time PCR技术的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因拷贝数变化。
检测基因突变的PCR 芯片
-等位基因特异性扩增和水解探针检测相结合，保证特异性
-基于ARMS®技术的引物可以特异性扩增含突变位点的靶序列
-可检测在野生型基因组DNA背景下低至1%的体细胞突变
-能检测福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样本
检测拷贝数变异的PCR 芯片
-采用Multicopy Reference Assay作为DNA input normalization
-即用型SYBR PCR Mastermix经优化，保证位点特异性扩增
-可检测新鲜、冷冻或者福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本
100 多种疾病和生物学通路相关的 PCR 芯片，可以针对性检测一系列基因的表达。其中包括诸如：
肿瘤相关 PCR 芯片
分子标志物PCR芯片
心血管疾病相关 PCR 芯片
细胞周期 PCR 芯片
细胞因子、炎症反应及相关免疫疾病PCR芯片
细胞外基质与粘附分子PCR芯片
神经生物学研究PCR芯片
信号转导相关基因表达PCR芯片
干细胞研究相关基因表达PCR芯片
毒理学与药物代谢相关PCR芯片
中枢神经系统疾病相关PCR芯片
免疫功能紊乱 PCR芯片
传染病 PCR芯片
代谢性疾病 PCR芯片
1、样品和实验质控，确保实验的准确性
2 、检测结果
1）芯片原始图片和原始数据。
2）客户指定分组的差异比较结果，包括标准化，两两分组比较，生物学重复三次以上可计算P-value。
3）根据实验结果绘制Scatter Plot，生物学重复三次以上可计算Volcano Plot。
4）Go & Pathway分析，找到与疾病和信号通路相关的差异蛋白，判断其是否具有显著意义。
- DNA水平：采用高通量测序、基因突变PCR芯片和sanger测序技术平台可以一次性检测人的全外显子组的基因突变或者插入缺失情况，也可以一次性检测几十个基因或者位点的突变、插入、缺失及拷贝数变化情况；
- RNA水平：采用基因表达PCR芯片、转录组测序技术平台，可以一次性检测人的全转录组水平基因表达、融合、突变情况，也可以通过Real Time PCR一次性检测几个、几十甚至几百个基因的表达情况；
- 蛋白质水平：采用抗体芯片技术，可以一次性检测几十甚至几百个蛋白的表达。也可以通过WB或者ELISA检测单个蛋白的表达水平。
- 生物信息学分析：生物芯片和高通量测序数据的深入挖掘。
1）实验流程
2）数据分析流程
- 高通量测序平台：可以进行外显子组测序、转录组测序和靶向捕获测序（即仅仅检测部分基因部分位点）
- 基因芯片平台：采用PCR芯片技术，检测基因突变、基因拷贝数变化和基因表达变化
- 蛋白芯片平台：采用抗体芯片技术，检测样品中蛋白表达变化、蛋白磷酸化水平和蛋白质相互作用
- Real Time PCR平台：每一个引物杏园都经过核酸分析仪的分析。确保了引物特异性。
- WB实验平台：采用专业化学发光成像系统，相比较传统的压片法，结果更加可靠。