ATAC-seq高通量测序数据分析
产品名称： ATAC-seq高通量测序数据分析
英文名称： ATAC-seq
产品编号： ATAC
产品价格： null
产品产地： null
品牌商标：
更新时间： 2023-11-30T00:11:20
使用范围： null
上海问组生物科技有限公司
- 联系人 : 余老师
- 地址 : 上海市奉贤区金海公路6055号11幢5层
- 邮编 :
- 所在区域 : 上海
- 电话 : 139****6049 点击查看
- 传真 : 点击查看
- 邮箱 : ding@bioinformatics.com.cn
ATAC-seq（Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughput sequencing）是结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。该方法由斯坦福大学的 William J. Greenleaf 和Howard Y. Chang在2013年共同开发。在 ATAC-seq 实验中，通过高活性 Tn5 转座酶将测序接头插入染色质的开放区域，然后进行测序，通过测序数据推断染色质区域的可及性，并可以计算转录因子结合位点和核小体的区域位置等。
问组生物ATAC分析主要包括：
1.原始数据质控
2.片段长度分布质控
3.样品相关性
4.富集峰鉴定和注释
5.富集峰长度分布
6.TSS周围reads分布热图
7.Motif分析
8.差异分析
9.GO富集分析
10.KEGG通路富集分析
11.可视化