Affymetrix SNP芯片服务

Affymetrix Axiom Genotyping Solution

Affymetrix Axiom基因分型平台支持全基因组关联和候选基因关联研究。研究者将不再受困于固定内容的芯片，全新的基因分型平台采用酶接到、单碱基测序步骤来确保实验的低成本、分型结果的高重复性和流程的全自动化。

该款产品参照HapMap和1000 Genomes Project数据库设计探针，与GeneTitan^TM配套使用可同时处理96个样本，每个样品能检测多至567.096个SNP位点。

Affymetrix SNP Array 6.0服务

Affymetrix Genome-Wide SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化的探针。

1. 482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片；

2. 424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs，X，Y染色体和线粒体上更具代

3. 表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP；

4. 202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针，这些区域来源的于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测；

5. 744,000个探针平均分配到整个基因组上，用来发现求知的拷贝数变异区域。

具体应用：除了进行拷贝数研究外，还为基因分型和LOH研究提供帮助，从而能够进行：
UPD检测、亲子鉴定、异常的亲代起源分析（针对UPD和缺失）、纯合性分析、血缘关系鉴定。


服务内容： 

1. DNA抽提； 

2. 样品质检：用琼脂糖凝胶电泳或LAB-ON-CHIP系统对样品DNA进行质量检测和定量； 

3. 实验过程：

a、扩增，标记； b、杂交、洗脱（具体见左图）； 

4. 图像扫描：用Affymetrix Scanner3000 7G激光共聚焦扫描仪对杂交结束后的芯片进行扫描； 

5. 数据处理：确定检出的SNP位点相应的核苷酸。

Affymetrix Mouse Deversity Genotyping Array