Reduced Representation Bisulfite Sequencing（RRBS）是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法，通过酶切富集启动子及CpG岛区域，并进行Bisulfite测序，同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的热点，与基因表达、表型性状息息相关。RRBS作为一种高性价比的甲基化研究方法，在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用前景。利用RRBS可以实现多个样本的比对基因组分析。

技术路线

生物信息服务

样品要求

1）样品总量：≥ 3 μg DNA（常规样本），≥ 5 μg DNA（FFPE或降解DNA样本）；

2）样品纯度：OD260/280 = 1.8-2.0；

3）样品完整性：DNA无明显降解与蛋白污染，需提供凝胶电泳检测胶图；

应用领域

 通过对多种人类细胞类型进行甲基化谱系研究，发现非CpG甲基化主要存在于多能干细胞，并随着分化而减少最后在体细胞中完全消失。而且非CpG甲基化可以在iPS细胞中重新被激活。非CpG甲基化和DNMT3表达水平很强的相关性，敲除DNMTA和DNMT3B基因的人类胚胎干细胞使得非CpG甲基化程度降低。总之，这些研究结果有助于进一步对我们理解人类细胞中的胞嘧啶甲基化模式。

参考文献

[1] Wang Hao, Matthew T,QuHongzhu,Widespread plasticity in CTCF occupancy linked to DNA methylation.Genome Research,2012, doi: 10.1101/gr.136101.111

[2] Ziller MJ, Müller F, Liao J, et al. Genomic distribution and inter-sample variation of non-CpG methylation across Human Cell Types.PLoS Genet., 2011,7:e1002389.