IL6/STAT3信号转导通路PCR芯片可检测参与IL6/STAT3信号的激活和下游效应的84个关键基因的表达，可用于研究IL6/STAT3信号通路的活性状况：激活、抑制或不变。炎症性细胞因子IL6是STAT3的激活分子的一员，通过其受体IL-6（IL6R/IL6ST（GP130））传递信号，激活Janus激酶，这又反过来使STAT家族（信号转导因子和转录激活因子），包括STAT3磷酸化并激活。IL6/STAT3信号通路在感染和癌变等生物过程中激活炎症反应。STAT3的靶基因与NFκB信号通路靶基因高度重叠，后者是另一个促炎症反应的关键信号通路。癌变过程中，特别是肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的相互作用时，STAT3信号往往是上调的。上调涉及的生物过程包括：分化、增殖、血管生成和细胞凋亡等。芯片包含IL6/STAT3信号通路的激活因子、下游调控因子、靶基因等，例如NFκB信号通路的细胞因子和基因，以及16个实验得到的与IL6/STAT3信号转导通路有关的关键生物标记物基因。通过这16个基因的相对表达水平和分类算法可以得到一个通路活性分数，这个分数可用于分辨实验样本IL6/STAT3信号通路的活性状况。通过实时定量PCR的方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测IL6/STAT3信号相关的基因表达。
IL6/STAT3 Signaling: STAT3 Activators: EGFR, IL10, IL11, IL17A, IL21, IL23A, IL6. Receptors: CD4, CD40 (TNFRSF5), CSF3R (GM-CSFR), FAS (TNFRSF6), IL18R1, IL1R1, IL2RA (CD25), IL6R, IL6ST (GP130), LIFR, TNFRSF10B (DR5), TNFRSF1A, TNFRSF1B. Upstream Signaling: AKT1, JAK2, JAK3, MAP2K1 (MEK1), MAPK1 (ERK2), MAPK14, MAPK3 (ERK1), MAPK8 (JNK1), MTOR, MYC, PIAS3, SOCS1, SOCS3, SRC, TYK2. Downstream Signaling: BAX, BCL2, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), HGF, MET, PIM1, STAT3. Target Genes: CCL2 (MCP-1), CCL5 (RANTES), CEBPD, CXCL10 (INP10), IL10, IL11, IL17A, IL1B, IL21, IL6, IL8, MYC, SOCS3. Cytokines: CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1A), CCL4 (MIP-1B), CCL5 (RANTES), CD40LG (TNFSF5), CSF1 (MCSF), CSF2 (GM-CSF), CSF3 (GCSF), CXCL10 (INP10), FASLG (TNFSF6), IL10, IL11, IL13, IL15, IL17A, IL18, IL1A, IL1B, IL2, IL21, IL22, IL23A, IL3, IL4, IL5, IL6, IL8, LIF, LTA (TNFB), OSM, TNF, TNFSF10 (TRAIL). NFκB Signaling: NFKB1, NFKBIA (IκBα/MAD3), RELA, TLR4. Pathway Activity Signature Genes: BCL3, CASP4, CEBPD, GLRX, IFITM2, IL6ST, JUNB, NRP1, PHF21A, PROS1, PVRL2, SOCS3, STAT3, TGM2, TNFRSF1A, TUBB2A