small RNA测序/miRNA测序
产品名称： small RNA测序/miRNA测序
英文名称： small RNA测序/miRNA测序
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Small RNA测序
Small RNA（包括miRNAs、siRNAs和piRNAs等）是生命活动中重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢紊乱发挥着重要的作用。基于Illumina高通量测序平台的small RNA测序技术不受物种限制，具有高灵敏度和高精确性，既能鉴定特定条件下表达的miRNA，也能发现新的miRNA。同时还可用生物信息学分析筛选在特定条件下差异表达的miRNA。
欧易特色
● 高度灵活性：可研究任一17～35 nt之间小RNA分子
● 高度精确性：可精确到单核苷酸水平，非常有利于区分高度同源的小RNA分子和鉴定小RNA的多态性
● 检测动力学范围广：可在超过6个数量级范围内实现准确的序列检测和定量分析，有利于低丰度小RNA差异表达的研究
● 数据质量高：深度测序保证了抽样随机性，可靠性和重复性高，与实时定量PCR结果具有较高的一致性
项目流程
获取total RNA---测序文库构建---上机测序---原始测序数据---数据质控---数据分析
数据分析内容
标准数据分析
● small RNA测序数据预处理
·数据处理统计 ·Reads长度分布统计
·Reads拷贝数统计
● 序列比对注释高质量Ref tag构建
·参考基因组比对 ·miRBase数据库比对注释
·Rfam数据库比对 ·Gene比对 ·Repbase比对
·Reads分类注释汇总
● 已知miRNA鉴定
● 新miRNA预测
·新miRNA预测 ·新miRNA二级结构预测
● miRNA差异分析（已知/新预测）
·miRNA表达量统计 ·miRNA差异筛选
● 差异miRNA靶基因预测（已知/新预测）
·差异miRNA靶基因预测
·差异miRNA靶基因GO富集分析
·差异miRNA靶基因KEGG富集分析
高级数据分析
● 已知miRNA分析
·miRNA簇分析 ·碱基编辑分析 ·miRNA家族分析
● miRNA-mRNA负调控关联分析、负调控网络图绘制
样品要求
● Total RNA：≥2 μg ● OD260/280为1.8-2.2
● 适用范围：真核生物（有、无参考基因组皆可）