eccDNA-seq高通量测序分析
产品名称： eccDNA-seq高通量测序分析
英文名称： eccDNA-seq
产品编号： eccDNA
产品价格： null
产品产地： null
品牌商标： null
更新时间： 2023-11-30T00:09:54
使用范围： null
上海问组生物科技有限公司
- 联系人 : 余老师
- 地址 : 上海市奉贤区金海公路6055号11幢5层
- 邮编 :
- 所在区域 : 上海
- 电话 : 139****6049 点击查看
- 传真 : 点击查看
- 邮箱 : ding@bioinformatics.com.cn
染色体外环状DNA（extrachromosomal circular DNA，eccDNA）广泛存在于真核生物细胞中，它们游离于染色体基因组之外，由基因组分离或脱落形成。eccDNA长度从几十bp到几十万bp。人们发现肿瘤细胞中存在大量eccDNA，且携带原癌基因，可以通过增加癌基因的表达促进肿瘤发生。此外，eccDNA还与耐药、衰老、肿瘤异质性、细胞间交流等功能相关。eccDNA已经成为生命科学领域新的研究热点。
eccDNA测序结合环状DNA富集，滚环扩增和高通量测序技术检测并定量样品中的eccDNA，为eccDNA在疾病中的功能研究奠定基础。
问组生物eccDNA分析内容包括：
1，原始数据质控
2，eccDNA鉴定和注释
3，eccDNA长度分布
4，差异eccDNA
5，eccDNA来源基因的GO富集分析
6，eccDNA来源基因的KEGG通路富集分析
7，eccDNA染色体分布
8，可视化