概述

 Illumina针对人、小鼠的完整RNA样本开发了全基因组表达谱芯片产品（采用直接杂交的方法）, Illumina全基因组表达谱微珠芯片使得在更高通量水平上的生物学研究成为可能，可以广泛地应用于高置信度靶位点发掘，疾病分子分型和分子通路分析等研究领域上。研究人员现在可以在一张芯片上获取多个样本的全基因组表达谱。

芯片品牌：美国Illumina

芯片名称：HumanHT-12 v4 Expression BeadChip

芯片信息：每张芯片可平行检测12个样本，含有共约48,000个基因转录本，信息来源除36,000个NCBI RefSeq外，还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。

芯片名称：Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip

芯片信息：针对降解RNA，采用独特的探针设计技术，从石蜡包埋组织、福尔马林保存样本中获得部分降解的RNA进行全基因组水平基因表达研究。每张可平行检测12个样本，包含47231个基因转录本。

芯片名称：MouseWG-6 v2 Expression BeadChip

芯片信息：每张芯片可平行检测 6 个样本，包含有约 45,281 个来自 MEMBO-RefSeq 及其补充序列，RIKEN补充序列的转录本信息。

技术路线

l  晶能另为客户提供的表达谱芯片有：

Affymetrix 表达谱芯片服务

Agilent 表达谱芯片服务

生物信息学分析模块

样品要求

1） 样品类型：细胞、新鲜组织或总RNA样品。

2） 样品量：细胞样品请提供至少5×106个细胞，组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。总RNA样品请提供总量2μg以上。

3） 样品质量：RNA无明显降解，OD260/280值在1.9和2.1之间，浓度≥ 100ng/μl；DNA应该去除干净。

4） 细胞样品或新鲜组织块（切成～50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

5） 样品运输：细胞或者组织样品；或者总RNA样本置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。

参考文献

[1] Julie B. Sneddon, Malgorzata Borowiak & Douglas A. Melton.Self-renewal of embryonic-stem-cell-derived progenitors by organ-matched mesenchyme.Nature. 2012 Nov 29;491(7426):765-8. doi: 10.1038/nature11463. Epub 2012 Oct 7.

[2]Gillich A, Bao S, Grabole N, Hayashi K, Trotter MW, Pasque V, Magnúsdóttir E, Surani MA. Epiblast stem cell-based system reveals reprogramming synergy of germline factors.Cell Stem Cell. 2012 April 6; 10(4): 425–439.doi:  10.1016/j.stem.2012.01.020