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Affymetrix人基因组SNP芯片6.0

Affymetrix人基因组SNP芯片6.0

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产品名称: Affymetrix人基因组SNP芯片6.0

英文名称: Human Genome-Wide SNP Array 6.0

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    人全基因组SNP芯片6.0是唯一可以真正将CNP(拷贝数多态性)转化成高分辨率的参考图谱的平台。可提供的遗传变异数目比其他任何产品都多,面板信息量大,覆盖基因组范围最广。包括180万个遗传变异,至少有906,600个SNPs和946,000个CNV探针。
 
技术原理流程:
    全基因组DNA(500ng)经过Nsp I 和 Sty I限制酶切,连接到接有4bp接头的受体上,所有的酶切产物,不管长短都与受体连接。利用可识别受体序列的通用引物来扩增该片段,PCR条件优化至最利于扩增200-1100bp的片段。两种酶切产物的PCR片段进行连接,经聚苯乙烯纯化,然后破碎、标记、与SNP Array 6.0进行杂交。
 
 
1.基因组DNA模板的准备
对DNA质量的要求:双链;不含PCR限制因子;不能被污染;DNA不能高度降解。经验证,血液和细胞系来源的基因组DNA满足上述要求。
2.  Sty 限制酶切。
3.  Sty 连接:用T4连接酶与普通的接头进行连接。
4.  Sty PCR:单引物扩增。
5.  Nsp 限制酶切
6.  Nsp 连接:用T4连接酶与普通的接头进行连接。
7.  Nsp PCR:单引物扩增。
8.  微孔过滤器对PCR 产物进行纯化。
9.  质量检测。
10.片段破碎:DNAse I对片段进行破碎。
11.标记。用末端转脱氧核苷酰酶进行末端标记。
12.与目标分子杂交。
 
服务项目(价格请咨询健海客户服务部):
 
Affymetrix Human SNP杂交服务包括杂交、扫描和数据分析。
DNA提取包括基因组DNA提取、测定OD值、用生物分析仪检测质量。
荧光定量检测DNA质量样本需要是96-孔板,每板最多24样本。
Human SNP Array 6.0全服务包括标签探针的标记,杂交,扫描和数据分析。