样本收集一天之内不能完成?
多中心样本如何收集避免批间差?
采集点距离仪器点山高水远?
担心运输是否影响基因的表达?
单细胞测序目前多采取仪器上门的服务模式,为保证细胞活力,取下新鲜组织后,样本即刻被制备成单细胞悬液,并在短时间内完成上机。因此,就出现了上面这些常见问题。样本的收集与运输难,甚至在一定程度上限制了单细胞技术的深入推广。
伯豪生物集中研发力量联合攻关,自主研发了组织样本保存液,并且探索出低温保存的方法,助您击溃单细胞研究路上的拦路虎。
文献支持:
BMC Genomics 杂志 18 年发表的一项研究成果,介绍了以组织保存液 HTS-FRS 为基础的单细胞低温保存技术。
保存液低温保存样本用于单细胞分析的工作流程 [1]
研究人员使用流式细胞术比较了新鲜和保存液处理的小鼠肾脏细胞的存活率,并通过 scRNA-seq 分析,验证了保存液低温保存组织样本策略在长达 3 天的保存过程中,能够有效保持肾脏的细胞群体异质性、转录组完整性和免疫细胞转录组稳定性。该研究表明,在 4℃条件下,组织保存液能够完好保存原始样本,适用于进行较长距离运输。
保存液低温保存能够维持细胞转录组稳定性
应用案例:
最近发表的一篇 Nature Immunology 的文章,证实了使用低温保存样本用于单细胞转录组学分析肾脏样本的可行性 [2]。采用低温存储策略可以最大限度地减少批次效应,防止一些细微的基因表达特征被掩盖。虽然这种策略可能导致中性粒细胞的损失,并且可能会改变其他细胞亚群的相对频率,但并没有观察到由于组织保存液而对基因表达产生了主要影响。
结论:
组织保存液 + 低温保存的操作方法,非常类似于临床中对于标本的常规处理,因此使客户参与单细胞样本准备变得切实可行,这对于 scRNA-seq 样本运输、样本质量保证而言至关重要。相信组织保存液 + 低温保存的方法的推行,一定会对您的单细胞的研究有所助益。
一、单细胞测序 - 组织保存液
* 该产品仅供科研使用
产品货号:21903-10
货号 | 产品名称 | 规格 |
21903-10 | 伯优 TM 单细胞测序 组织保存液 | 2ml 管 /10 支 / 盒 |
1、产品介绍
本产品可用于人和动物的新鲜组织样本的低温存储和运输,4°C 条件下 72 小时内可保持细胞活性。保存后的组织样本可直接用于单细胞悬液制备,无需复苏等操作。经测试验证,经本产品保存的新鲜组织样本,制备成单细胞悬液后可用于目前主流单细胞测序平台,包括 10X Genomics 和 BD Rhapsody。
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货号:21903-10
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产品规格:10 × 2ml
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储存条件:2-8°C 避光保存
注:该产品仅供科研使用。
2、性能测试
细胞活性
新鲜组织样本在 4°C 条件下,72 小时内可保持细胞活性。
小鼠脾脏细胞活性测试(4°C,24-72h)
不同组织的细胞活性测试(4°C,2-60h)
基因表达测试
通过基因芯片,对新鲜组织和保存后的组织进行基因表达检测,相关性超过 0.95,结果表明,在 4°C 条件,组织保存液能够维持转录组的稳定性。
图 基因表达稳定性测试(4°C,24-96h)
3、操作说明
二、单细胞测序 - 细胞保存液
货号 | 产品名称 | 规格 |
21904-10 | 伯优 TM 单细胞测序 细胞保存液 | 2ml 管 /10 支 / 盒 |
适用范围
本产品可用于人和动物的细胞系培养细胞、组织消化细胞、流式分选细胞等单细胞悬液的低温存储和运输,4°C 条件下 96 小时内可保持细胞活性。保存后的细胞可用于目前主流单细胞测序平台,包括 10x Genomics 和 BD Rhapsody。
注:该产品仅供科研使用。