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http://www.yfswbio.com 第一个研究小组利用染色质特征来解读基因组,他们利用多种人类细胞类型中各种不同组蛋白标记的染色质图,分辨不同染色质状态,这对于解答人类疾病具有意义。来自哈佛大学,霍德华休斯医学院等处的研究人员提供了多种人类细胞类型中各种不同组蛋白标记的染色质图一览,利用所获得的这些数据,有可能来识别不同染色质状态,它们相应于不同调控元素,如被抑制的和活跃的启动子、增强子和绝缘子。几种与疾病相关的单核苷酸多态性被发现与调控元素重叠。这项工作对于了解人类疾病、尤其对于解读“全基因组关联研究”的结果有意义。
另外来自宾夕法尼亚大学的研究人员通过一种新的实验技术,对基因组中所有成分实现高度控制,生成均匀一致的染色质串珠结构,并开发出分析染色体结构的计算机工具,揭示染色体复杂的组装过程。
染色体由DNA链和相关蛋白质缠绕弯曲,高度压缩包装而成。研究小组首先从酵母菌细胞中提取完整的DNA染色体组,经过培养提纯,然后加入相等分量经纯化的组蛋白(DNA与组蛋白的重量比例固定为1∶1)。组蛋白是DNA链缠绕成染色体的基本材料,这样包装过程就开始了。
经过包装后,细长的DNA基因链包围着一颗颗组蛋白形成串珠一样称为核小体的小结,均匀分布在未打结的DNA链上。核小体是一种染色质结构,进一步卷曲压缩则成为染色体。之前其他研究显示,组蛋白和DNA也能各自沿着DNA链制造一些核小体结点,但这些串珠的整体结构却和细胞内形成的染色质大不一样。
研究小组找到了一种新方法,在实验中加入了酵母菌提取物和ATP,染色质改造酶从ATP中提取了必须的能量,沿着DNA重新配置核小体,重新构造出与细胞内染色质一样的人造染色质结构。最关键的是,研究小组还开发出一种计算机图形组装算法,成为从外部研究染色体成分的有力工具,这样,科学家就能“看到”酵母菌细胞中超过6万多个核小体形成染色质的排列方式,从而首次在实验中实际探测到了染色体的结构、功能和它们的组成基因。
来源:生物通