微生物群落多样主要包括物种多样性、遗传多样性和功能多样性3个方面,在环境、能源、食品与人体健康等诸多领域有着广泛的研究与应用。16SrRNA扩增子测序技术是微生物群落多样性检测最常用的组学技术之一,该技术无需对微生物分离培养,直接提取样本里面所有微生物的基因组,利用合适的通用引物扩增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高变区或功能基因,采用高通量测序仪Miseq、Hiseq或Novaseq对其进行测序,通过生物信息学分析可以获得特定实验样品中细菌、真菌或古菌等的物种组成、物种丰度、系统进化、群落比较等诸多信息。
01
16S rDNA测序
16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,具有10个保守区域和9个可变区域,其中保守区在细菌间差异不大(反映了生物物种间的亲缘关系),可变区具有属或种的特异性。对16S rDNA某个可变区进行测序,可用于研究微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。
原核微生物的16S rRNA基因长度约为1500 bp,二代测序平台对应扩增引物一般选用V3-V4区域或V4区域,三代测序平台可选用全长扩增引物(27F/1492R)。
02
18S rDNA测序
18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。对 18S rDNA某个高变区进行测序,用于研究环境样本中真核微生物群落结构多样性。
真核微生物18S rRNA基因长度1500-2000 bp,引物一般选用V4区域。
16S rDNA测序
16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,具有10个保守区域和9个可变区域,其中保守区在细菌间差异不大(反映了生物物种间的亲缘关系),可变区具有属或种的特异性。对16S rDNA某个可变区进行测序,可用于研究微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。
原核微生物的16S rRNA基因长度约为1500 bp,二代测序平台对应扩增引物一般选用V3-V4区域或V4区域,三代测序平台可选用全长扩增引物(27F/1492R)。
03
ITS测序
ITS分为两个区域:ITS1和 ITS2,ITS1位于真核生物rDNA序列18S和 5.8S之间,ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1(350 bp)或ITS2(400 bp)进行测序,用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。
ITS区长度则为400-900 bp,引物一般选用ITS1区域。
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宏条形码测序
DNA条形码(DNA barcode)是可以代表物种的、有足够变异的、易扩增且相对较短的生物DNA片段。宏条形码技术结合了DNA条形码和高通量测序技术的优势,使用特异性引物对目标生物类群的基因进行扩增,并通过高通量测序技术增加测序深度,从而增加对环境DNA的覆盖度和识别度。05
目标区域扩增子测序
利用二代高通量测序技术,对某些目标基因(如产甲烷古菌,固氮菌等)的PCR产物进行测序及分析。
产品介绍
01
16S rDNA文库建库试剂盒利用高通量测序技术对16S rDNA中V3-V4或V4区片段进行扩增,结合生物信息学技术,检测特定环境下的微生物,鉴定所检细菌种类,提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。试剂盒中包含进行细菌16S rDNA扩增的所有试剂、16S PCR扩增引物F/R,组合Illumina 和MGI平台 Index 引物试剂盒用于16S rDNA片段的扩增。
产品应用
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科学研究:进行微生物群落结构和功能研究;
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临床监测:用于疾病诊断、感染控制和治疗监测;
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环境监测:评估环境样本中的微生物多样性和污染情况;
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农业研究:研究土壤微生物群落对作物生长的影响;
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能源领域:特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发;
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食品相关监测:检测和控制食品中的微生物污染。
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产品特点
03
适用多样本类型:兼容大多数常见环境样本,如土壤、粪便、水体、生物膜等;
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高效率扩增:灵敏度低至0.1 ng,特异性优,均一性好;
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测序数据质量高:低背景、高覆盖度、高均一性。
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性能展示
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产品信息
05
应用方向 |
产品名称 |
货号 |
规格 |
提取试剂盒 |
18526ES20 |
20 T |
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18526ES50 |
50 T |
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16S rDNA鉴定 |
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12983ES08 |
8 T |
12983ES24 |
24 T |
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12983ES96 |
96 T |
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16S(V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI |
12933ES08 |
8 T |
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12933ES24 |
24 T |
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12933ES96 |
96 T |
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16S/18S/ITS/宏条形码/功能基因扩增子等 |
13283ES03 |
1 mL |
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13283ES08 |
5×1mL |
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16S 全长多重扩增试剂 |
10158ES03 |
1 mL |